北京城市快轨建设管理有限公司前身为北京东直门机场快速轨道有限公司，成立于2001年7月，是专为投资、建设、运营首都机场线而设立的。2005年首都机场线开工建设，2008年7月19日，机场线如期通车运营，成为北京奥运会期间的主要交通工具，为奥运会的顺利举行推波助澜，其独特的设计、快捷的穿梭、舒适的乘坐同样获得了国际好评。

2009年初，基于在机场线建设中锻炼出来的奋发进取的建设团队和丰富扎实的建设经验，公司再次被北京市政府指派为北京地铁15号线一期工程的建设单位，并于2010年底、2011年底、2014年底先后开通15号线一期中段（望京西-后沙峪）、东段（后沙峪-俸伯），西段（清华东-望京西）极大缓解了顺义地区百姓进城的难题，加快了顺义新城建设。

目前公司负责建设管理的在建线路有16号线、机场线西延、平谷线、新机场线A部分。其中，16号线首开段（西苑－北安河）计划2016年底开通，机场线西延正在施工中，平谷线计划2016年底开工。线路建成后，将对缓解首都地面交通压力、方便市民出行及推动经济和社会发展发挥重要作用。